Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM25Q14258 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM25Q14258 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM25Q14258 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM25Q14258 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM25Q14258 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM25Q14258 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM25Q14258 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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TRIM25Q14258 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TRIM25Q14258 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM25Q14258 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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