Protein–RNA interactions for Protein: Q14197

MRPL58, Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL58Q14197 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MRPL58Q14197 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MRPL58Q14197 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms