Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1A4Q13733 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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