Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUL1Q13616 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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