Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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