Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
XRCC4Q13426 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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