Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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