Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFIAQ12857 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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