Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF5Q12774 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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