Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DSC2Q02487 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms