Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXC5Q00444 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HOXC5Q00444 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms