Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP2C1P98194 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP2C1P98194 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms