Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NCALDP61601 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NCALDP61601 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms