Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PTPRG-203ENST00000474889 9021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TMEM258P61165 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms