Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ERVFC1-1P60608 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms