Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BACE1P56817 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BACE1P56817 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms