Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA8P53708 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms