Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms