Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA8P48165 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA8P48165 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA8P48165 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms