Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTGER1P34995 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms