Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LMO1P25800 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LMO1P25800 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO1P25800 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO1P25800 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO1P25800 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO1P25800 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LMO1P25800 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LMO1P25800 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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