Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA1P17302 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA1P17302 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA1P17302 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA1P17302 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA1P17302 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA1P17302 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA1P17302 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA1P17302 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms