Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT3P12035 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT3P12035 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms