Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms