Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEBLO76041 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEBLO76041 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEBLO76041 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms