Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NIPSNAP2O75323 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms