Protein–RNA interactions for Protein: O75146

HIP1R, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1RO75146 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIP1RO75146 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms