Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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