Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRT4C9JH25 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms