Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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C4orf47A7E2U8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C4orf47A7E2U8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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