Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
A6NDN8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
A6NDN8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms