Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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