Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms