Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAPPC4Q9Y296 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAPPC4Q9Y296 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms