Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCSK1NQ9UHG2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCSK1NQ9UHG2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms