Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CGGBP1Q9UFW8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms