Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLKQ9UBT6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLKQ9UBT6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms