Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRPC4Q9UBN4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms