Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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