Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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