Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms