Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms