Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC46A2Q9BY10 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms