Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRRTQ9BXP5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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