Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms