Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP47Q96K76 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms