Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERAC1Q96JX3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms