Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAP3Q96FM1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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