Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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UBXN4Q92575 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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UBXN4Q92575 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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UBXN4Q92575 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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UBXN4Q92575 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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UBXN4Q92575 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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UBXN4Q92575 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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UBXN4Q92575 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBXN4Q92575 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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