Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3AQ92484 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms